La finalidad del Sector aguas de la Cooperativa, es la de proveer y suministrar agua en calidad potable según normas vigentes. El agua a tratar es sustraída del arroyo Piray Mini, la cual es direccionada por medio de estaciones de bombas elevadoras a la planta potabilizadora. Una vez potabilizada el agua es distribuida por una red de cañerías al domicilio de cada socio. La producción de agua cuenta con 7 módulos compactos y 11 perforaciones.
El agua distribuida en los sectores de Eldorado se encuentra controlada según normas vigentes, con un control de calidad diario en lo que respecta a la calidad bacteriológica y fisicoquímica. El sector CEEL Aguas se encuentra conformado en seis áreas bien definidas: Área de Redes, Área de Mantenimiento, Área de Producción, Área de Administración, Área de Cloacas y Área de Ingeniería.